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在一座與世隔絕的小島上，一群孩子平靜的生活被IcA（國(guó)際基因協(xié)會(huì)）的突然造訪打破。原本就對(duì)外部勢(shì)力充滿警惕的孩子們，因莉婭的一則預(yù)言陷入了巨大的恐慌與混亂之中，自此，小島被卷入了一場(chǎng)驚心動(dòng)魄的危機(jī)漩渦。

莉婭的預(yù)言宛如一顆重磅炸彈，瞬間在小島上引發(fā)軒然大波。馬克斯憤怒地?fù)]舞著魚叉，認(rèn)定IcA居心不良，堅(jiān)決主張將其驅(qū)逐；露娜則焦急地哭著，強(qiáng)調(diào)IcA可能掌握著對(duì)抗普羅維登斯的關(guān)鍵情報(bào)，不能輕易放過這個(gè)機(jī)會(huì)。雙方各執(zhí)一詞，爭(zhēng)吵聲此起彼伏。最終，11號(hào)為了探尋普羅維登斯的陰謀，決定帶領(lǐng)阿雅和凱倫與IcA代表威廉進(jìn)行談判。然而，談判過程中，阿雅用基因檢測(cè)儀發(fā)現(xiàn)威廉的公文包里藏著能鎖定孩子們基因信號(hào)的微型追蹤器，這一發(fā)現(xiàn)瞬間激化了矛盾。

馬克斯聽到密室里的動(dòng)靜后，誤以為IcA要對(duì)11號(hào)等人不利，立即帶著一群手持自制武器的孩子沖進(jìn)密室。威廉的手下也迅速掏槍，雙方劍拔弩張，一場(chǎng)沖突一觸即發(fā)。關(guān)鍵時(shí)刻，11號(hào)挺身而出，大聲怒吼喝止了雙方，暫時(shí)穩(wěn)住了局面。在11號(hào)的強(qiáng)硬要求下，威廉當(dāng)著眾人的面毀掉了追蹤器，這場(chǎng)危機(jī)才得以暫時(shí)平息。

風(fēng)波稍定，威廉向孩子們展示了一個(gè)驚人的情報(bào)。他打開黑色箱子，全息投影儀投射出的地圖上，密密麻麻的紅色標(biāo)記顯示著普羅維登斯的實(shí)驗(yàn)室。威廉嚴(yán)肅地指出，其中一個(gè)實(shí)驗(yàn)室正在研制可怕的“末日病毒”，這種病毒能夠改寫人類基因，將人變成任人擺布的傀儡。凱倫進(jìn)一步發(fā)現(xiàn)，這個(gè)實(shí)驗(yàn)室距離小島不到200公里，且病毒已進(jìn)入最后的測(cè)試階段。更令人震驚的是，孩子們的基因中竟然蘊(yùn)含著能完美中和病毒的特殊物質(zhì)，這也是普羅維登斯執(zhí)著于抓捕他們的原因。

就在大家商議應(yīng)對(duì)之策時(shí)，島上的警報(bào)突然響起。凱倫發(fā)現(xiàn)防御系統(tǒng)遭到黑客入侵，正在自動(dòng)關(guān)閉。11號(hào)果斷下令，讓阿雅和馬克斯帶人前往控制中心排查。在那里，他們發(fā)現(xiàn)了威廉的一個(gè)手下正在瘋狂刪除數(shù)據(jù)。面對(duì)質(zhì)問，這名手下不僅毫無(wú)悔意，還掏出槍進(jìn)行威脅。馬克斯怒不可遏，率先沖上前與他展開搏斗。在激烈的打斗中，馬克斯雖然勇猛，但也逐漸落入下風(fēng)。危急時(shí)刻，11號(hào)及時(shí)出手，將內(nèi)鬼制服，眾人這才發(fā)現(xiàn)他脖子后面的普羅維登斯條形碼標(biāo)記，證實(shí)了他的叛徒身份。

內(nèi)鬼被制服后，普羅維登斯的無(wú)人機(jī)群鋪天蓋地地襲來(lái)。此時(shí)的小島防御系統(tǒng)尚未恢復(fù)，情況萬(wàn)分危急。就在眾人絕望之際，威廉站了出來(lái)，他表示自己帶來(lái)的Emp干擾器能夠癱瘓無(wú)人機(jī)，并提出了一個(gè)冒險(xiǎn)的計(jì)劃：由11號(hào)帶人吸引無(wú)人機(jī)群的火力，為他爭(zhēng)取在燈塔上安裝干擾器的時(shí)間。盡管對(duì)IcA仍心存疑慮，但為了守護(hù)小島，11號(hào)還是決定冒險(xiǎn)一試，馬克斯、露娜等孩子也紛紛響應(yīng)，主動(dòng)加入戰(zhàn)斗。

海灘上，孩子們與無(wú)人機(jī)展開了激烈的對(duì)抗。露娜用投石機(jī)擊落無(wú)人機(jī)，馬克斯揮舞魚叉與敵人近身搏斗，11號(hào)則全力保護(hù)著同伴。威廉帶領(lǐng)其他人爭(zhēng)分奪秒地在燈塔上安裝干擾器。然而，普羅維登斯的第二波無(wú)人機(jī)群裝備了抗電磁干擾裝置，繼續(xù)發(fā)動(dòng)攻擊。關(guān)鍵時(shí)刻，凱倫對(duì)干擾器進(jìn)行超頻改裝，成功釋放出強(qiáng)大的電磁脈沖，將所有無(wú)人機(jī)癱瘓，小島終于轉(zhuǎn)危為安。

戰(zhàn)斗結(jié)束后，威廉真誠(chéng)地向11號(hào)表達(dá)了合作的意愿，他坦言IcA過去確實(shí)做過許多錯(cuò)事，但這次真心希望能與孩子們攜手，共同阻止普羅維登斯的邪惡計(jì)劃。11號(hào)盯著威廉看了許久，最終伸出手，握住了他的手。這一刻，曾經(jīng)的對(duì)立與猜疑暫時(shí)放下，雙方達(dá)成了意外的同盟，共同踏上了對(duì)抗普羅維登斯的艱難征程 。