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馮保得知此事后，第二天就向李太后告狀。李太后得知后極為憤怒，甚至揚(yáng)言要廢掉朱翊鈞，改立他的弟弟潞王為帝。朱翊鈞意識(shí)到問題的嚴(yán)重性，趕忙長(zhǎng)跪懇求太后原諒。最終在朱翊鈞的萬般哀求下，李太后才松口，但還是逼著他寫了一份向全天下公布的罪己詔。同時(shí)，作為對(duì)他的懲罰，朱翊鈞被要求在慈寧宮長(zhǎng)跪三個(gè)時(shí)辰。

在萬歷十一年，朱栩鈞在一些事情上與司禮監(jiān)掌印太監(jiān)馮保產(chǎn)生了矛盾。當(dāng)時(shí)，萬歷帝打了馮保的養(yǎng)子。馮保得知后，覺得這是一個(gè)可以向太后告狀的機(jī)會(huì)，便將此事添油加醋地告知了李太后。

李太后對(duì)萬歷帝的行為極為震怒。李太后一直對(duì)萬歷帝的教育和行為規(guī)范十分嚴(yán)格，期望他能成為一位賢明的君主。她認(rèn)為萬歷帝此舉不僅有失皇家尊嚴(yán)，而且對(duì)朝廷重臣的親屬動(dòng)手，是不恰當(dāng)且不符合帝王行為規(guī)范的。

于是，李太后揚(yáng)言要召集內(nèi)閣，以萬歷帝行為失當(dāng)為由，廢掉他的皇帝之位，改立其他皇子。朱翊鈞得知此事后，大驚失色。他深知太后的威嚴(yán)和決心，一旦太后真的召集內(nèi)閣商議廢帝之事，那后果將不堪設(shè)想。

為了平息太后的怒火，保住自己的皇位，朱翊鈞連忙趕到太后跟前，下跪請(qǐng)罪。他在太后面前表現(xiàn)得極為誠(chéng)懇，深刻地認(rèn)識(shí)到自己的錯(cuò)誤，并且表示愿意悔改，以后會(huì)更加注意自己的言行舉止，遵守皇家規(guī)范，努力做一個(gè)合格的皇帝。

李太后看到朱翊鈞如此誠(chéng)懇地認(rèn)錯(cuò)，心中的怒氣逐漸消了下來。她考慮到萬歷帝畢竟是自己的親生兒子，且年紀(jì)尚輕，可能會(huì)有一些沖動(dòng)之舉，最終決定原諒他，此事也就此告終。

“媽的！朕只不過教訓(xùn)了一下奴才，沒有一個(gè)人幫朕說一句好話！可如今蕭如薰呢？?jī)H僅是犯了一點(diǎn)小錯(cuò)，滿朝文武居然都給他說情？朕這個(gè)皇帝就這么不值得文武百官待見嗎？”

朱栩鈞想起了以前的事，他越想越氣，猛地一拍龍椅扶手：\"都給朕起來！蕭如薰的功勞朕心里有數(shù)！\"他瞇起眼睛掃視下面跪著的大臣，冷笑一聲，\"不過朕倒要問問，什么時(shí)候，大臣納個(gè)小妾這樣上不了臺(tái)面的事，都要你們?nèi)w跑來求情了？\"