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公孫瓚領兵征討張純有功，升為騎都尉。

后因屬國烏桓的首領貪至王率軍向公孫瓚投降，公孫瓚又被提拔成為中郎將，加封都亭侯，駐守遼西屬國。

此后的五六年間，公孫瓚常與胡人發(fā)生爭戰(zhàn)。

漢靈帝中平年間（184年—189年），公孫瓚與張純、丘力居等人遼東屬國石門交手，張純等大敗，公孫瓚追敵過深，后方無援，在遼西管子城被丘力居包圍。

歷經二百多天，兵困馬乏，彈盡糧絕，雙方損失慘重。

公孫瓚被朝廷任命為降虜校尉，封都亭侯，兼任屬國長史。

公孫瓚鎮(zhèn)守邊境，奮勇殺敵，經常鏖戰(zhàn)至深夜，敵寇畏其名聲與英勇，無人再敢侵犯邊境。

初平二年（191年），青州、徐州的黃巾大舉入侵渤海（今河北省滄州市南皮縣東北），約達三十萬人，欲與黑山賊軍會合。

公孫瓚帶領兩萬的步卒、騎兵，于東光之南大破黃巾，斬首了三萬多人。

公孫瓚趁敵人逃渡黃河之際發(fā)起進攻，再次擊敗黃巾。

死者數萬，公孫瓚軍隊生擒敵方七萬余人，物資數不勝數。

從此公孫瓚威名遠揚，正逢董卓率軍到達洛陽，令公孫瓚接任奮武將軍，封薊侯。

公孫瓚自持兵力強大，便放縱自己的部隊，多次掠奪百姓，而劉虞則對百姓十分仁愛，二人政見不一，在對待胡人態(tài)度方面經常產生分歧。

關東義士聯手征討董卓，董卓脅漢獻帝劉協西走長安。

劉協欲東歸洛陽，命劉虞之子劉和逃出長安以求劉虞組織軍隊相迎。

袁術想利用劉和來威脅劉虞，從而協助自己，于是在半路將劉和扣押。

公孫瓚知袁術有稱帝野心，所以多次阻止劉虞派兵。

之后公孫瓚又怕此行得罪袁術，派自己的堂弟公孫越率領大批軍馬向袁術示好。

私下里又讓袁術繼續(xù)監(jiān)禁劉和，企圖兼并劉虞的軍隊。

因此公孫瓚與劉虞隔閡越來越深，劉虞為緩和關系多次邀請公孫瓚赴宴，但公孫瓚認為劉虞設鴻門宴，于是推脫不去，公孫瓚與劉虞嫌隙越來越深，無法消解。

孫堅在陽城抵抗董卓的軍隊時，袁術命令公孫瓚堂弟公孫越前去援助孫堅，但公孫越不巧被箭矢射中去世了。

公孫瓚大怒，認為他堂弟之死是袁紹導致的，親自率軍討伐袁紹，冀州各郡也都紛紛叛離袁紹而轉奔公孫瓚集團。

袁紹聞訊，急忙派公孫瓚的另一個堂弟公孫范前去擔任渤海郡太守，以示友好。

公孫范赴任后就倒戈向公孫瓚，幫助其占領青州、徐州，使得公孫瓚的軍力日益強盛，公孫瓚與袁紹也因此結怨。